En liten komet slår ner på Jorden innehållande medvetandet från en av Joshuas tidigare studenter, Lucas. Medvetandet placeras i ett nytt experimentellt skal (Sable) som har mer Gua DNA än andra skal. Hon har förmågan att kunna träffas av kulor utan att dö som andra Gua, och alla hennes sinnen är starkare. Joshua skickar ett falskt e-mail till Eddie som lockar Cade till en ö där man ordnar med en fälla, i vilken Cades förmågor kommer att testas av Lucas (Sable).

Eddies vem som är en astronom, ser en bild av ett Gua maskhål som skickar medvetande till Jorden. Han berättar om detta för Eddie, och detta är Cades chans att bevisa att utomjordingar befinner sig på Jorden. Innan dom kan få tag på all info, blir hans vän mördad och ett paket med bilderna skickas till en Senator. Nu måste Cade ta dem från Senatorn.

En motorcykelgäng har gjort sig själva till förkämpar för Cade Rymdvarelsejägaren, efter att dom läst hans dagbok. Dom gör allt för att hitta och döda Gua, vilket inkluderar att oskyldiga människor dödas i processen.

Cade undersöker en grupp parapsykiska när han hör talas om att en av dem kan se den andres dröm, när hon dör i drömmen vilket orsakar hennes död i verkligheten.

Lokala tidningar berättar om hur sjukvårdare återupplivade en servitris på Rhode Island, efter 6 minuter utan att hennes hjärta slagit. Hon vaknar upp talande spådomar, bara det att orden är Nostradamus. Nyheterna har kastat sig över detta, och Cade räknar ut att även Gua är på väg dit. Så han måste hitta och prata med henne före dem.

En röd flagga ges till den bäste i militären. Cade vill veta hur den Röda flaggan, och Gua är sammanhängande. Eddie hjälper Cade att få AAA identitetspapper och bli en av dom 5 tävlande.

Winchala stamråd är på väg att rösta, angående en expansion för spel på hela deras reservat. De äldste i rådet har ett viktigt beslut att ta.

Guas andrebefäl, Ministern kommer till Jorden för att försöka hitta alla förrädare, som försöker stoppa den Andra Vågen.

Franchesca Dunton som försvann utan några spår för över 55 år sedan, hittas levande i en cementvägg i en tunnel. Cade ger sig ut att vara hennes sonson Jack, för att kunna prata med henne. Cade försöker ta reda på om utomjordingarna har begravt henne levande, och hur hon kan ha överlevt så länge.

Cade går tillbaka till sitt förflutna, som snabbt kolliderar med hans nutid. När han börjar arbeta som en inbrottstjuv åt ett gäng, som är ute efter någonting i Silicon Valley. Cade undrar om Gua stjäl datorvapen, som senare ska användas mot mänskligheten.

Cade misstänker att Gua experimenterar med ett förlorande fotbollslag i Ohio, efter att laget får en imponerande vinstperiod.

Cade följer upp ett e-mail från Paranoid Times webbsida, som leder honom till Pittsburgh sökande efter utomjordisk aktivitet. Cade gör sedan misstaget att tolka Nostradamus' profetia felaktigt. Polisen och Gua är i hälarna på Cade. och han beslutar att ta en gisslan.

Robbie Harlock, en regelbunden besökare på Paranoid Times webbsida, skickar upprepade maila till dem och informerar dem om hans väns bisarra dödsfall, Carson McCullof. Vid hans flickvän Lauras poolparty.

Eddie går till hans läroverksåterförening. Gua försöker hitta Eddie för att få tag på den gömda Nostradamus boken.

Cade färdas till en alternativ dimension, där han upptäcker försvunna tonåringar som är en del av ett Gua experiment för att testa ilska. Tonåringarna har ställts mot varandra i lag (röda & blå), för att slåss mot varandra för mat.

En utomjording tömmer kvinnor på deras hormoner, vilket hjälper Gua att bli osårbara.

Cade hittar Guaglob i en portfölj i en bil. Bilen exploderas och han hamnar i koma, när han vaknar befinner han sig på en av regeringens baser som jagar Gua.

Foster undersöker Guas infiltration av en forskning om människans aggression, vid Human Genome Project i Atlanta. Han anlitar hjälp från sin före detta cellkompis Healy, en uppåtsträvande proffsboxare. Foster ger sig ut att vara boxarens tränare, och de två anmäler sig till forskningen.

Foster upptäcker att Gua utför ett hemligt experiment i en övergiven del av anläggningen. Genom att använda DNA från proffsboxare, försöker dom att ta fram en superkrigare.

Joshua har funnits skyldig för högförräderi mot Gua, och döms till 'omstrukturering' Guaversionen av hjärntvätt. Efter att han gått igenom omstruktureringen, verkar Joshua endast vara en skugga av sitt gamla jag. Och hans medkänsla mot människorna verkar ha raderats.

Precis när överförandet av hans medvetande ska påbörjas, kastar sig Foster genom labbets dörr skjutande och försvinner med en förvirrad Joshua.

Foster kommer till en strippklubb i Kansas City som ägs av gangsterbossen Sammy 'The Horse' Kozak, som nyligen blev målet för okända våldsmän. Cade som misstänker att Gua är ute efter att infiltrera den organiserade brottsligheten, börjar jobba för Sammy.

Foster upptäcker en annan gangster, Jack Mitchum, som man tror är ansvarig för Sammys problem. Han och Sammy fångar in och förhör Mitchum, som påstår att han arbetar för Gua.

Fosters värsta mardrömmar blir sanna. Gua har tagit över Jorden och har upprättat ett starkt militaristiskt samhälle, som bland annat inkluderar underkuvande och tortyr på en nödlidande mänsklig befolkning. Han har inga minnen av dom senaste elva åren, och Foster söker hjälp från en Gua konkubin vid namn Claire.

För att få hjälp med att bygga upp det förflutna. Tillsammans lyckas dom att lokalisera Crazy Eddie, och de tre är fast beslutna att starta en motståndsrörelse och ta tillbaka Jorden.

Phil Tennant en populär Soffprogramvärd, planerar att diskutera den beryktade Cade Foster som huvudtema i sitt program. Innan showen startar, bryter sig Foster och Eddie in i studion och tar staben som gisslan. Dom planerar att använda sig av showens satellitsändare, för att kunna informera alla miljoner tittare angående Guas existens, och deras planer att ta över Jorden.