Stridsskeppen Pegasus och Galactica går i strid med Cylonska basskepp, i en strid som kommer att ändra krigets ansikte. Men för Löjtnant Kara Thrace är det riktiga kriget, med sitt samvete, när hon stålsätter sig själv för att utföra Befälhavare Adamas order att lönnmörda Amiral Cain.

När Lee Adama pratar med Kara och hon berättar om ordern, konfronterar han sin pappa och utmanar moralen och laglighet i ordern. Men Befälhavare Adama förblir beslutsam. För flottans bästa säger han till sin son, måste Amiral Cain avlägsnas.

Under tiden angrips misshandlas Galen Tyrol och Helo i Pegasus arrest, som hämnd för mordet på en av deras officerare. Endast ett ingripande i sista stund av Pegasus XO, stoppar misshandeln från att få dödlig utgång.

När striden för att förstöra Cylonernas ”återuppväckarskepp”, stegras, blir medlemmarna från bägge stridsskeppen tvungna att avgöra, hur mycket av deras mänsklighet de är villiga att offra för att överleva. Slutligen börjar striden med ett heroisk självuppoffring, och avslutas i ett test av de två befälhavarnas kurage - och deras karaktär.