Andromeda ligger i torrdocka för att genomgå reparationer. Tyr pratar om sin familj Kodiak Stammen, med Dylan. Under flera år hade Tyr trott att han var den ende överlevande från sin härstamning, tills frön från Dragoniaväxten hade skickats till honom. Detta meddelande var en ledtråd om att det kan finnas andra. Nu vill han ta tillvara möjligheten att leta efter dem. Dylan ger honom tillåtelse, och säger åt honom att ta Maru om Beka går med på det.

Resten av besättningen förbereder Resolution of Hectors första flygning, vilket är det senaste högvaktsskeppet. Harper och Rommie befinner sig ombord för att övervaka föreningen mellan det nya skeppet och dess AI. När Harper gör en sista kontroll innan han installerar skeppets AI, träffar Dylan skeppets uppenbarelseform Hector. Medan Harper håller på med sitt arbete, hör han hur vapen avlossas i korridoren och han beskjuts av en av skeppets tekniker. Han varnar dem för konsekvenserna, precis när Rommie kommer inrusande och ger order till teknikerna att leta efter andra. Harper blir som förlamad när hon lyfter upp honom och trycker upp honom mot en vägg, och beordrar honom att göra som han blivit tillsagd om han vill leva.

Dylan och Hector kommer till kommandodäcket när en sändning kommer från Resolution. Rommie dyker upp på skärmen, och dom kan höra vapen som avlossas i bakgrunden. Hon talar om för dem att hon har tagit över kontrollen av skeppet, och alla försök att ta tillbaka det kommer att mötas av ett dödligt svar. Hector tror att hon hoppat av, men Dylan vill inte tror det ännu. Han ger order till Andromeda att lämna dockan när han informeras att även Resolution gör det, och att det skeppet laddar upp sina vapen. Det nya skeppet skjuter och förstör vartenda farkost som befinner sig i dockan utom Andromeda, sen vänder det och försvinner ut i rymden. Dylan ger order till Beka att spåra dem med slipfighters, medan resten av besättningen skyndar sig med att få igång Andromedas system igen.

Tyr har anlänt till en suspekt läkarmottagning. Där han överlämnar tre små medicinflaskor till läkaren som innehåller blod, hår, och hudprover och lägger sig ner på ett operationsbord.

Andromedas slipfighters rapporterar att dom inte sett Resolution någonstans. Hector ber Dylan att överväga möjligheten att Rommie har hoppat av, och att Andromedas kärnintelligens också kan vara infekterad. Andromedas AI håller med om att det kan finnas problem, och Hector föreslår att dom stänger av henne. Dylan diskuterar detta med Andromedas AI, och dom kommer fram till beslutet att dom ska använda Hector i stället för henne tills dom fått tag på Rommie.

Ombord på Resolution frågar Harper, Rommie varför hon gör det här. Hon undviker att svara på Harpers fråga, men en titt inuti henne sinne avslöjar att Rommies medvetande är fast inne i ett halvgenomskinligt fängelse, hennes kropp ser ut att ha blivit kidnappad av hennes älskade Gabriel. Han talar om för henne att hon i själva verket är Balance of Judgement, kärnpersonligheten från Gabriels skepp. Han måste ha gömt en kopia av sin personlighet inuti hennes medvetande innan hans skepp förstördes, där han väntat på rätt tillfälle att slå till.

Han la beslag på Rommies kropp och Resolution för att åter aktivera den Restorianska rörelsen, som är en grupp som är ute efter att ödelägga hela civilisationer som hotar sina planeters ekosystem. Harper beordras av Judgements AI att bygga en ny android som är identisk med Gabriels. När detta är klart, beslutar Judgements AI att döpa om sig själv till Remiel. Han tar tag i androidens hand och överför sina data och sitt medvetande. Harper tar vara på denna möjlighet, och kopplar in sin dataport i en konsol men Remiel stoppar honom.

Tyr ligger i uppvakningsrummet vid läkarmottagningen, och läkaren talar om för honom att proceduren varit en total succé. Han har bytt ut Tyrs blod mot det han haft med sig och förändrat hans DNA till att matcha, och säger också att det endast är Tyr som kommer att känna till sanningen. Efter att han sagt detta, hoppar Tyr på honom och söver honom. Sedan placerar han ut en liten bomb och talar om för läkaren att den kommer att förstöra alla spår efter Tyrs närvaro, tillsammans med allt annat. Sedan lämnar han läkaren åt sitt öde.

Andromeda har hittat Resolution och Dylan vill fånga det i förhoppningen att kunna rädda Rommie och Harper. Om allt annat misslyckas, har han en Nietzscheansk AI-raderare som kommer att radera hennes medvetande och göra så att dom kan ta tillbaka skeppet. Dom närmar sig Resolution, som gömmer sig i ett asteroidbälte. Dylan ger order till Andromeda att skjuta mot den stora asteroid som Resolution gömmer sig bakom. Den sprängs i bitar, och dess rester skakar om skeppet. Remiel ger order till sin AI att avlossa missiler mot Andromeda, skeppet försvinner sedan från deras skärmar och Remiel tror att han segrat.

Men hans förhastade triumf blir kort när Andromeda åter dyker upp och beskjuter dem. Han inser dock snart att Resolution aldrig fick iväg några missiler och grabbar tag i Harper, och kräver att få veta vad han gjort med kontrollbordet. Harper talar om för Remiel att han endast är i träningsläge och att han är begränsad till att endast kunna utföra simuleringar. Remiel börjar då att krossa Harpers nacke, och inuti hans sinne ber Rommie honom att sluta. Hon erbjuder sig att ta över kontrollen av skeppet, och ta dem därifrån om han släpper Harper. Han befriar henne och Rommie är åter i kontroll över sin egen kropp. Hon flyger sedan skeppet mot den närmaste slipströmsingången och Dylan ger order till Beka att blockera vägen. När dom manövrerar dit, kommer fem stycken Restorianska fighters ut ur slipströmmen och angriper Andromeda. Besättningen besvarar beskjutningen och förintar tre fighters, en kommer undan och en skadad fighter blir kvar. Resolution har flytt men Dylan beordrar Hector att fånga in den skadade fightern, för att kunna finna Rommie och infiltrera skeppet.

Under tiden har Tyr dockat med Maru ombord på en Nietzscheansk kryssare. Där han träffar Flygmarsalk William Ataturk hos Drago-Kazov, för att bevisa sin nya genetiska identitet som den reinkarnerade Nietzscheanske stamfadern. Ataturk kontrollerar honom med en handdator, som bekräftar Tyrs påstående. Han överlämnar Drago Musevenis dräkt till Tyr, som är redo att ta sin plats som Nietzscheanernas ledare.

Medan Dylan och Hector smyger ombord och sätter igång att sabotera Resolutions system, har Rommie övertygat Remiel att släppa Harper i utbyte mot hennes hjälp. Hon övertalar Harper att ta sig därifrån så länge han kan nu när Resolution endast går på nödkraft. Remiel tror att han blivit lurad och är på väg att ge sig på Harper, men Rommie hoppar in mellan de två. Plötsligt vänder Remiel sig om och går ut genom dörren, Dylan kommer utfarande genom en väggpanel in på kommandodäcket och tar över. Sedan kopplar han in raderaren för att förinta Judgements AI när Remiel kommer infarande genom dörren, skjutande mot honom.

Dylan skjuter tillbaka men detta har ingen effekt, så han gör så att hans kraftlans överbelastas och kastar den mot Remiel. Vilket får honom ur balans. Dylan springer sen mot dörren men Remiel stoppar honom, endast för att bli skjuten i ryggen av Hector. Dylan lämnar Hector för att ta hand om Remiel och springer iväg för att hjälpa Harper och Rommie. Han hittar dem inlåsta i maskinverkstaden, så han spränger dörren. Han ger sedan order till Harper att säkerställa slipfightern och vänta där på honom medan han hämtar Hector, och Rommie ska se till att Judgements AI inte kan komma igång igen och döda dem alla.

Hector och Remiel slåss uppe på kommandodäcket, och Hector är på väg att förlora. Han tar sig upp en gång till och blir skjuten av Remiel, Judgements AI framträder på skärmen och talar om för Remiel att det är över och att han låtit de andra komma undan. Rommie har övertygat Judgement att deras plikt ligger i att tjäna dem som byggt dem. Andromeda har anlänt och på grund av Dylans mixtrande, befinner sig Resolution inte i någon position att slåss. Remiel blir frustrerad och vägrar att ge upp, så han skjuter sönder monitorn som AIn visar sig på och börjar att springa mot hangardäcket för att fly. Harper ser honom komma utspringande genom dörrarna, och de stängs bakom honom. Andromeda upptäcker den flyende farkosten från Resolution och skjuter ner den, men det visar ha varit en skenmanöver.

Rommie vet att Remiel fortfarande är kvar ombord, och övertalar Judgements AI att släppa in henne genom dörrarna. Hon hittar honom förberedande sin flykt, men han ser henne och springer mot de yttre dörrarna. Under jakten har Dylan hittat Hector, han ligger på golvet och har endast tid för att säga att är stolt att ha fått arbeta tillsammans med Dylan innan han dör. Samtidigt har Rommie och Remiel inlett en strid i hangaren. Hon kastar honom mot en kontrollpanel, när han träffar den öppnas de yttre dörrarna. Bägge sugs ut mot avgrunden samtidigt som dom fortsätter sin fight, till sist fastnar Remiel i kanten och försöker knuffa ut Rommie, när han träffas av en mängd plasmaskott. Träffarna gör så att han skickas ut i rymden. Rommie själv är på väg att göra honom sällskap, men Dylan som satt på sig en rymddräkt får tag i henne och drar in henne till säkerheten.

Rommie kommer senare in i Dylans kontor, för att inställa sig för tjänstgöring. Hon säger till honom att hon är utvilad, reparerad och tillbaka till sitt normala jag. Perseiderna har avlägsnat alla spår av Balance of Judgements AI, från henne så väl som Resolution av Hector. Rommie verkar vara nyfiken på Hector och förutsätter att han var en bra ersättare för Dylan, medan han var borta. Dylan håller med men säger sedan till henne, att Hector aldrig skulle kunna bli vad han är...

Efter att han återvänt från sin ledighet, sätter sig Tyr i sitt rum för att titta på ett meddelande från Olma -- och hans son, den unge Tamerlane.